Het nettoverlies bedroeg bijna 20 miljoen euro, tegen een winst van bijna 106 miljoen euro een jaar eerder.
De Ierse budgetmaatschappij had onlangs al gewaarschuwd voor zwakkere cijfers over het hele gebroken boekjaar. Volgens Ryanair zal het jaarresultaat uitkomen op 1 miljard tot 1,1 miljard euro.
Er wordt niet uitgesloten dat de winstprognose in verband met de Brexit nog verder omlaag moet. Ook kunnen de ticketprijzen nog verder dalen.
Ryanair stelde de verwachtingen in oktober ook al naar beneden bij. Toen werden problemen met de vakbonden en stijgende brandstofkosten als redenen genoemd.
Het aantal door Ryanair vervoerde passagiers kwam in de afgelopen periode uit op 32,7 miljoen. Dat komt neer op een stijging van 8 procent op jaarbasis. De omzet ging met 9 procent omhoog tot meer dan 1,5 miljard euro.