Hij zal worden uitgeleverd aan het Internationaal Strafhof (ICC) in Den Haag, meldde het ICC.
Volgens het strafhof komt de aanhouding van Patrice-Edouard Nagaissona nadat een arrestatiebevel tegen hem was uitgevaardigd.
Volgens de aanklagers van het ICC was hij de leider van de anti-Bakala-militie die systematische aanvallen uitvoerde op de moslimbevolking van het land in de periode 2013-2014.
Door het geweld tussen de Seleka (een coalitie van gewapende moslimgroeperingen) en de christelijke anti-Balaka zouden duizenden mensen zijn gedood en honderdduizenden ontheemd geraakt. Op 24 september 2014 opende de aanklager van het ICC, Fatou Bensouda, een onderzoek naar de situatie.
Ngaissona kreeg tot onvrede van mensenrechtenorganisaties eerder dit jaar een hoge functie bij de Afrikaanse voetbalbond.