De premier had gezegd dat hij niet op de hoogte was van de operatie om de zes te deporteren. Die waren donderdag in Kosovo gearresteerd omdat ze banden zouden hebben met scholen die gefinancierd worden door de Fethullah Gülen-beweging. Ankara geeft die de schuld voor de mislukte coup van 2016.
''Beiden worden ontslagen vanwege de arrestaties die gisteren hebben plaatsgevonden", zei een hoge regeringsfunctionaris.
Volgens het Turkse staatspersbureau Anadolu hielden de uitgeleverde mannen zich bezig met de rekrutering van nieuwe leden op de Balkan en het werven van fondsen. Ook zouden zij Gülen-aanhangers hebben geholpen uit Turkije te ontsnappen.
Turkije is een belangrijke investeerder in Kosovo. Volgens een hoge Kosovaarse ambtenaar zou de Turkse regering grote druk hebben uitgeoefend op het straatarme Balkanland om op te treden tegen de Gülen-scholen.